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上海海事大学机械工程设计研究所是在原机械系港口机械研究所的基础上发展成立。下设起重机设计、运输机械、机械设计测试与失效分析、气力输送与环保工程等4个研究室和新产品开发室。该所主要进行起重机械及工索具、运输机械、通用机械方面的科研、技术改造和新产品开发；港口机械及通用机械的性能测试和质量检验；机械设备的维护管理及其失效分析；机电控制系统和自动化；气力输送技术和环保工程的研究设计开发，集装箱咨询服务等项目。
