学院充分利用其自身学科与专业优势，积极开展科学研究。2008年到2011年来先后获得国家国防科工局核能开发与国防基础科研项目、核废物地质处置项目、国家自然科学基金、科技部国防合作、“863”计划和“973”计划项目、科技支疆项目等国家级项目以及一批省部级及横向科研项目共计20余项。获国家专利1项，出版教材1部，发表论文100余篇，其中被SCI、EI、ISTP收录近20篇，核心期刊60余篇。
学院积极开展对外交流。先后与德国波鸿大学、英国威尔士大学、冰岛联合国大学、乌兹别克斯坦科学院微生物研究所等知名院所建立了良好的科研合作关系。一方面通过外国专家局引智项目引进国际知名专家来学院讲学与合作研究，另一方面，选派学术骨干到国外进行高级访问、研修、培训及学术交流等。使学科始终走在其发展的前沿。
