据2018年7月研究所官网显示，岩溶地质研究所人员编制数为275人（含非营利编制120人）。全所有人员360人，其中：在职职工211人，离退休人员149人。在职职工中，科技人员175人，其中：正高级职称32人（含院士1人），副高级职称44人；中级职称67人，初级职称55人，其他13人。
中国科学院院士：袁道先
岩溶所拥有岩溶动力系统与全球变化国际联合研究中心、自然资源部/广西岩溶动力学重点实验室、自然资源部岩溶生态系统与石漠化治理重点实验室、中国地质调查局岩溶塌陷防治重点实验室、中国地质调查局全球气候变化地质研究中心、广西重大科技创新基地和广西岩溶地质工程技术研究中心，以及11个野外科学观测研究基地（其中4个为部级）。中国地质学会岩溶地质专业委员会和洞穴专业委员会挂靠岩溶所。
联合国教科文组织国际岩溶研究中心和国际标准化组织（ISO）岩溶技术委员会（编号：ISO/TC319）落户岩溶所。
下设研究室：岩溶动力学研究室、岩溶区域地质研究室、岩溶资源研究室、岩溶生态与石漠化研究室、岩溶工程与灾害研究室、岩溶景观与洞穴研究室、岩溶探测技术方法研究室
