加拿大一枝黄花的危害主要表现在对本地生态平衡的破坏和对本地生物多样性的威胁。这是由于加拿大一枝黄花具有强大的竞争优势，体现在：①繁殖能力强，无性有性结合；②传播能力强，远近结合；③生长期长，在其他秋季杂草枯萎或停止生长的时候，加拿大一枝黄花依然茂盛，花黄叶绿，而且地下根茎继续横走，不断蚕食其他杂草的领地，而此时其他杂草已无力与之竞争。这三个特点使得它对所到之处本土物种产生严重威胁，易成为单一的加拿大一枝黄花生长区。另一方面是由于加拿大一枝黄花的根部分泌一种物质，这种物质可以抑制糖槭幼苗生长，也抑制包括自身在内的草本植物发芽。
根据观察发现，加拿大一枝黄花主要危害的是荒地和免耕地，在有人工栽培措施的地方很少发现。
