根据上述职责，古蔺县国土资源局设6个内设机构:

（一）办公室

负责文秘、文电、会务、接待、机要、档案等机关日常运转工作；承担信息综合、新闻宣传、新闻发布、政务公开、安全保密工作；牵头办理人大、政协提案、议案；组织国土资源课题调研；承担机关固定资产管理、综合业务与协调处理工作；承办全系统的机构编制、人事管理和教育培训等工作；承办系统内部人员的考察、考核、任免、培训、流动调配等工作;负责全系统离退休人员管理工作。承担机关效能建设、绩效考核和督查督办等工作；负责全县国土资源系统的党风廉政建设、行业作风建设。参与管理土地、矿产等资源性资产和国家出资形成的矿业权权益的有关工作；承担国土资源专项收入征管工作；承担国家、省、市、县财政安排有关工作经费、专项资金、基金的管理工作和部门预决算、国库集中支付等机关财务工作；负责全系统的财务工作，拟订系统内部财务、资产管理办法，监督管理系统内部的国有资产。

（二）行政审批服务股（法规监察股）

（三）规划和耕地保护股

（四）土地利用股

（五）地籍测绘股(古蔺县测绘管理办公室)

（六）地质矿产管理股

组织编制和实施地质灾害防治规划和预案；组织协调全县地质灾害防治工作；承担监督管理古生物化石、地质遗迹、矿业遗迹等重要保护区、保护地的工作，保护矿山地质环境，依法管理水文地质、工程地质、环境地质勘查和评价工作；组织监测、监督防止地下水过量开采和污染造成的地质环境破坏，承担城市地质、农业地质、旅游地质、矿山地质、区域地质的勘查与评价工作，负责矿山地质环境治理恢复项目的申报工作。承担矿产资源规划、勘查、开发、储量管理职能。编制矿产资源总体规划、矿产资源勘查规划和矿业权设置方案，组织全县区域地质调查和矿产资源调查评价；承担采矿权审批登记发证，建立健全矿业权市场；监督管理矿产资源勘查、开采活动，调处矿业权属纠纷；组织开展全县矿产资源开发利用年度检查、矿山统计年报，承担矿产资源储量登记、统计工作；实施矿山储量动态监督管理，建立健全县矿产资源储量审查专家库。