建筑工程实验中心下设四个二级实验室：建筑工程实验室、建筑节能实验室、建筑学实验室、工程力学实验室，共有结构试验室、建筑测量室、土力学室、建筑材料室、工程管理室、市政工程室、建筑节能室、建筑环境一室（热工室）、建筑环境二室（暖通空调室）、环境测试室、建筑模型室、数字建筑室、力学一室、力学二室（流体力学室）等14个实验分室。

其中，建筑节能实验室是嘉兴市重点建设实验室。实验室现有资产1200多万元，仪器设备1600多台（套），实验室建筑面积5000多平方米。

建筑工程实验中心拥有微机控制电液伺服疲劳试验机、电液伺服万能压力试验机、全自动高压气固结仪和全自动三轴仪、全站仪、门窗气、水密性检测仪、建筑保温系统耐候性检测系统、传热系数测试仪、红外线热像仪、管道气密性检测装置等先进仪器设备。

能满足建筑工程学院所有实验教学和老师的科学研究，具备一定对外服务的能力，可以对混凝土、构件、管桩、建材等的抗压强度试验，材料和零部件的各种动静态力学性能试验，房屋、铁路、公路、桥梁、港口等建筑工程的测量与监测，建筑外窗综合物理性能如抗风压、气密性、水密性，外保温系统耐候性能，建筑围护结构热工缺陷检测，建筑、工程、施工和机械设计的技术图纸的出图等。

在中央与地方共建高校专项资金、浙江财政实验室建设专项资金以及学校的实验室建设专项资金资助下，建筑工程实验中心将不断进行续建和扩建，进一步增强为教学、科研和社会服务的能力。