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国土资源部地下水科学与工程重点实验室固定科研人员22人,实验技术人员9人,包括了中国地质科学院水文地质环境地质研究所创新研究基地的大部分优秀青年科技工作者。从年龄结构看,固定人员中40岁以下16人,占52%,40-50岁13人,占42%,50岁以上2人,占6%。客座研究人员35位。
在固定研究人员中,通过竞聘进入创新基地的研究员16人、副研究员10人。院士2人、博士生导师5人、硕士生导师8人、博士(后)17人、硕士8人。在客座人员中,教授和研究员31人,副研究员3人,博士生导师7人。