地表水环境影响评价工作一般分为三个阶段：

第一阶段为准备阶段。主要工作为研究评价对象相关文件，初步确定评价对象的废水排放量及水质，确定评价工作级别及评价范围．确定需重点关注的污染因子。

第二阶段为工作阶段。包括环境调查、制定监测方案与监测数据检查、现状评价、影响预测等几个步骤。

① 环境调查阶段，通过资料调研及现场踏勘等手段，准确地掌握拟评价地表水体的使用功能、水系关系、水文资料、水工设施、敏感目标位置、拟设排污口位置、沿线排污情况(主要污染源入河位置、排污量、主要污染物)等资料，尽可能以图表方式整理出完整的水系资料。如涉及水体有其他监测数据，应尽可能收集，以作为参照。

② 按照评价等级确定的评价范围，结合水环境调查情况，制定出水环境质量现状监测方案，由环境监测机构实施监测。当取得监测数据后，应对数据的有效性及合理性进行检查，如发现数据变化异常或与收集资料差异较大，应反馈监测机构进行数据核对。

③ 根据监测数据．对照评价标准进行水环境质量现状评价工作。

④ 根据水体水文特点和污染物特征，选取相应的预测模型，进行预测工作．模型中参数的选取，应通过计算或查阅资料等方法确定。

第三阶段为整理评价结论阶段。

地表水环境质量现状评价及影响预测评价结论，均为环境影响评价文件中的重要结论，对拟建评价项目的实施具有决定性的作用，必须体现工作的客观和全面，方能作为管理部门参考的依据。当出现不支持评价项目的结论时，应分析出制约因素及原因并反馈项目建设单位，通过调整建设方案等方法进行进一步论证。