三花龙胆蝼蛄

在播种后畦面的覆盖物下有蝼蛄为害，将麦麸炒香，用90%敌百虫或乐果15倍液将麦麸拌潮，一堆一堆放在畦边，进行诱杀。毒饵大约每亩4-5千克。

三花龙胆猝倒病

5月下旬至6月上旬发病盛期，猝倒病属真菌引起病害，病状为感病植株在叶片上出现水渍状，植株成片倒伏，5-8天后死亡，湿度过大，种植密度过高发病严重。一旦发病，停止浇水。用65%代森锰锌500倍液或多菌灵等杀菌剂进行防治。

三花龙胆叶腐病

叶腐病发生在两对真叶后到8月份，发病原因及症状为感病叶片萎蔫，逐渐变黑腐烂，重者边根烂掉，病区呈同心圆状向四周蔓延，温度高、湿度大利于发病。发病后暂停浇水，用甲基托布津800倍液或50%多菌灵1500倍液浇灌病区。发病前用700-800倍液多菌灵或500倍液代森锰锌进行叶面喷雾进行预防。

三花龙胆斑枯病

每年6月末到10月发病。此病是危害龙胆草严重的病害。患病叶片出现棕褐色圆形或椭圆形病斑，病斑中央颜色稍浅，边缘褐色，病斑两面处有黑小点，是病原菌的子实体分生孢子器，严重时病斑汇合，叶片枯死，最后导致整株枯萎。6月初至6月中旬用具65%代森锰锌400-500倍液每5-7天喷一次，从6月中旬至于10月用代森锰锌300倍液体3-5天喷一次。也可用于50%多菌灵400倍液体3-5天喷一次与代森锰锌交替使用。