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机电工程系是顺应社会需求在厦门大学重新崛起的高层次的工科院系之一, 现已拥有2个一级学科博士学位授权点( 仪器科学与技术、机械工程), 5个硕士学位授权点(测试计量技术及仪器、 精密仪器及机械、机械电子工程、机械制造及其自动化、机械设计理论)、2个工程硕士授权点(仪器仪表工程、机械工程)。本科专业设置横跨三个一级学科(仪器科学与技术、机械工程、电气工程)、 多个二级学科。