保护级别：该种列入中国国务院1999年8月4日批准的《国家重点保护野生植物名录（第一批）》：Ⅰ级。
保护现状：濒危种。1936年在中国广西大瑶山首次采得标本，截止到1998年多次去大瑶山调查采集、均未找到。 截止到2011年，科学家在中国贵州黔南经多次调查及样地资料分析后确认，异形玉叶金花在贵州分布区的植株总数不超过60株。许多原有的分布地点已找不到野生植株，也没有发现新的分布地点，这意味着在上述地区的野外，异形玉叶金花很可能已经灭绝。
保护措施：中国大瑶山已划为自然保护区，应进行广泛调查，弄清是否已经灭绝。如能发现，应注意保护，并引种栽培。
