(一)办公室
协助局领导对机关政务、业务等有关工作进行综合协调和监督检查;负责主要会议的组织、文电处理、对外联络、机关文书档案、机要、保密、信息、接待、机关后勤服务、提案、督促查办等工作;负责局目标管理、社会治安综合治理工作;会同有关股室搞好本系统“双文明”建设工作;管理全县水利系统的信息工作;负责局属各单位党组织建设工作;指导局属各单位的政治思想工作;承办机关的日常工作。
(二)工管股
负责全县范围内的水利工程管理工作
(三)农水股
负责全县范围内的农田水利基本建设与农村饮水安全工作。
(四)设计室
负责全县范围内水利工程勘察设计工作。
(五)水政水资源管理办公室
主要负责全县范围内地下水,地表水的征收管理,依法行政,维护水事秩序工作、
(六)水利派出所
负责全县范围内水利工程安全保卫工作,依法行政严惩破坏水利设施的违法犯罪分子。
(七)综治办
负责水利局及二级机构平安建设工作,排查不稳定因素及时消除不安定隐患,构建和谐局面。
(八)信访办
负责人民来信、来访工作。
(九)计生办
负责局机关及二级机构计划生育工作。
(十)水产股
负责全县范围内水产养殖,渔业执法,捕捞管理工作。
(十一)人事股
负责局机关及二级机构人事管理工作。
(十二)财务股
负责局机关及二级机构资金管理工作。
(十三)招商股
负责水利局招商引资工作。
(十四)内保股
负责局机关院内安全保卫工作。