根据《杭州市科学技术进步条例》的规定，由市科技局会同市经委、市发改委、市农办、市外经贸局、市财政局、市地税局、市信息办、市文广新闻出版局等部门组成认定委员会（办公室设在市科技局），负责市高新技术企业的认定、动态管理和考核工作。同时，认定委员会负责对省级、国家级高新技术企业的认定推荐、管理和考核工作。杭州高新开发区和杭州经济开发区内市级高新技术企业的认定工作授权两个开发区管委会负责，报市认定委员会办公室备案。

市认定委员会聘请有关专家组成专家咨询组，为申报企业提供咨询意见。

(一)高新技术企业的认定遵循公开、公平、公正原则，实行科技评估机构评估、认定委员会审定、向社会公布认定结果的基本程序。

(二)申请认定市高新技术企业的单位必须提交《杭州市高新技术企业认定申请书》及以下材料：

1.本单位工商营业执照副本(复印件)，国税、地税登记证(复印件)和法定代表人身份证明材料。

2.本单位情况简介(包括科研、生产及销售经营情况、资产状况、场地、设备、生产规模、人员组成及内部机构设置情况，产品质量保证体系、财务管理制度情况等内容)。

3.企业上月财务会计报表和经注册会计师审计的上年度财务会计报表。

4.本单位技术开发费的提取和使用证明。

5.本单位技术性收入、高新技术产品销售收入证明。

6.本单位专职专业技术人员的证明。

7.本单位研制或生产的高新技术成果、产品或技术的鉴定(验收、评审、登记)证书、技术标准、测试或质检报告等。

8.本单位银行贷款证和信誉等级证明(复印件)。

9.其他有关证明材料。

认定市高新技术企业申请书一式12份、其它材料一式3份统一报送到市认定委员会办公室。

在申报市高新技术企业的同时，一并申报省级高新技术企业认定的，采用省级企业申报材料(具体要求见《浙江省高新技术企业认定工作的实施意见》)。

(三)申报单位应首先委托经市科技局确认的具有科技评估资格的科技评估机构进行评估，评估费用由市科技局承担。科技评估机构根据认定条件，组织专家对企业的申报材料、数据进行核实、评估，出具评估意见，并承担相应的评估责任。企业申报材料必须由其主管部门(无主管部门的单位不要求)及同级财政、税务部门初审、签署意见并盖章。在具有法定资格的科技评估机构确认前，评估由市科技局组织专家进行。

(四)市高新技术企业认定采用常年受理，分批评审的方法，市认定委员会对企业申报材料进行定期审查，对申报市级高新技术企业认定的提出认定意见；对同时申报省级高新技术企业认定的，在确认同意推荐后，提出市级高新技术企业认定意见，并向社会公示征询意见。对认定的市级高新技术企业由市科技局发文公告，授予《杭州市高新技术企业》称号，并颁发相应证书。