根据上述职责，枞阳县招标投标管理局设2个内设机构：

（一）办公室

协助局领导管理机关日常工作和加强招投标管理；负责机关党建、人事、财务、固定资产、通讯等后勤事务管理和服务工作；负责制定机关内部管理制度和审核各科室、交易中心制定的各项规章制度；负责文秘档案、保密、政务公开和办公自动化管理工作；负责完成局领导交办的其他工作。

（二）业务股

负责建立县级评标专家库、代理机构、供应商备选库；负责建立招标采购当事人参与招标采购交易活动的诚信档案；负责对投标保证金、竞买保证金、履约保证金进行监督；负责对招标投标采购交易结果跟踪监督；负责协调处理招标投标采购交易活动中的争议事项；受理招标投标采购交易活动中的举报投诉，协助配合相关部门按照有关规定查处招标投标采购交易活动中的违规行为；负责制定招标投标采购交易活动具体制度，规范交易行为；负责招标采购文件等法定资料的备案审查；对招标投标采购交易中心的招标投标采购活动过程进行业务指导和管理。