梨香菊病虫害较少，病害主要有枯斑病、病毒病，虫害主要是蚜虫。

枯斑病(Septoria chrysanthemella Sacc.)又名叶枯病。一般于4月中、下旬发生，一直为害到菊花收获。植株下部叶片片首先发病，出现圆形或椭圆形紫褐色病班，大小不一，中心呈灰白色，周围褪绿，有一块褐色圈。后期叶片病斑上生小黑点(病原分生孢子器)，严重时病斑汇合，叶片变黑干革命枯，悬挂在茎秆上．4～9月雨水较多时，发病严重。防治方法：在最后一次菊花采摘后，即割去地上部植株，集中烧毁，减少越冬菌源：选健壮无病的菊花种苗，培育壮苗；适施氮肥，雨后开沟排水，降低田间湿度，减轻危害；发病初期，摘除病叶，并交替喷施l：1：100波尔多液和50%托布津1000倍液，选晴天，在露水干后喷药，每隔7～10天一次，续喷3次以上。

病毒病 发病植株，其叶片有褪绿斑，严重时叶片干枯，植株矮小或丛枝，枝条细小，开花少，花朵小，产量低。7-8月高温季节发生严重，发病时植株生长缓慢。防治方法：应用脱病毒品种或选育抗病的优良品，冬季清除腐植枯叶，集中销毁；及时治蚜防病，发病后可喷25~50ppm浓度的农用链霉素溶液或病毒灵800倍溶液防治。

蚜虫[Macrosiphoniella sanborni(Gillette)] 9~10月间集中于菊嫩梢，花蕾和叶背为害，吸取汁液，使叶片皱缩，花朵减少或变小。菊蚜一年发生20多代。防治方法：消除杂草，忌与菊种植物连作和间套作；发生期喷40%乐果2000倍液，每隔7天左右一次，连续喷2～3次。