办公室

承办局党政日常工作，负责交通行业精神文明建设；负责指导交通系统的计划生育、宣传报道工作；负责局机关及局管单位党的思想、组织、作风、统战、制度建设以及人事劳动工资和老干部管理等工作；组织、协调局机关的政务工作；负责起草综合性文稿、重要公文、年鉴；负责文秘、信息、档案、保密、统计、财务、办公自动化、接待、爱国卫生、直线电话、网络建设等工作。

运输管理科

负责编制全区水陆运输发展规划，提出年度运输计划；负责全区道路水路运输，汽车租赁的行业管理；审批或审核全区水陆运输行业、运输服务企业的开业申请，搞好运力投放和运力更新的宏观管理；协调、督促重点物资、紧急物资运输和春运、抢险救灾工作；指导文明场站建设；指导交通运输行业的安全管理，组织交通安全大检查；参与重大交通事故的查处。

交通建设科

组织编制全区交通建设发展计划，安排全区公路、水路年度投资计划；承办公路、水路建设工程项目建议书（可行性研究报告）的编制工作；负责全区交通工程建设管理，负责交通工程招投标、工程定额、造价管理、交通环境保护工作；督促检查工程施工进度、质量，提出拔款意见，组织交工验收、督促检查养护计划的执行情况；负责全区乡村道路建设工作；检查、督促、指导工程技术档案的归档工作。

交通战备办公室

区交通战备办公室为区国防动员委员会的办事机构。其主要职责是：负责制订全区交通战备建设规划和战时交通运输保障计划；指导编制重点线路、目标的战时保障方案；指导督促交通战备专业队伍建设，开展专业训练和战备演练；配合部队做好军事行动和其他紧急任务中的交通运输保障工作。

渡口安全管理办公室

区渡口管理办公室为区政府的常设机构。其主要职责是：协调、督促渡口所在地办事处（镇）、渡口经营者做好渡口安全工作，落实各项规章制度和安全措施；配合港航监督和船检部门，做好渡工、渡船的考核、培训、发证和年检年审工作，配合物价部门做好渡运票价的调整和审批；制订辖区内渡口建设规划，负责增设、变更和撤销渡口、渡船的审核等。

法制科

负责全区交通行业法制工作；组织实施行政执法责任制；负责交通行政执法监督检查、行政复议和行政诉讼工作；依法对交通行政处罚实施监督和指导；管理交通执法证件；组织交通行业政策研究工作；负责人大代表建议、议案和政协委员提案的办理；负责局系统的普法工作。

审批科

独立承担集中办理系统的行政许可事项和非行政许可类事项的审批。行政许可科进驻区政府行政服务中心交通窗口集中办公，接受区政府行政服务中心与区交通局双重领导和管理，统一受理、集中办理（包括材料审核和组织实质内容审查、盖章、证书制作）系统的行政许可类和非行政许可类审批事项，做到一个领导分管，一个窗口对外。

椒江区公路运输管理稽征所

贯彻执行各级政府和部门有关公路运输、公路稽征的方针、政策、法令；负责公路运输、搬运装卸、汽车维修等行业的管理；负责征收公路养路费、车辆购置附加费、公路建设基金、运输管理费和有关部门委托的代征税金和代收规费等；稽查车辆在公路运输中的违法违纪事件等。从而做到全面的指导、统筹、协调、服务、监督，促进公路运输事业的迅速发展。

椒江区公路管理段

认真执行交通部颁发的有关公路养护方针、政策；认真执行各项工程养护计划，切实做好公路养护管理工作；积极做好路产、路政、路权等工作。

海门轮渡公司

负责经营海门~前所的轮渡。

台州市都市公共交通有限公司

负责经营辖区内客运公交。

浙江金豹运业有限公司

负责长短途公路客货运输

椒江大桥实业有限公司

负责大桥收费。