河海大学机电工程学院的历史沿革可以追溯到常州电力机械厂机械职工大学。

1980年，原江苏省电力局下属的常州电力机械厂开始筹建机械职工大学，12月20日，国家电力部文件决定，从1981年起，将该厂划归电力部领导，并着手筹建常州电力职工大学。

1983年2月25日，常州电力职工大学被确认为水利电力部直属单位，水电部报请国务院审批建立水利电力部常州机械制造职工大学。5月31日，国家教委批复水利电力部，同意成立水利电力部常州机械制造职工大学。

1985年，水电部常州机械制造职工大学和常州电力机械厂划归河海大学（原华东水利学院）领导管理。

1986年2月13日，经河海大学申请，国家教委同意扩大河海大学办学规模，在水电部常州机械制造职工大学的基础上建立河海大学机械学院。11月26日，河海大学机械学院在常州成立。

1995年12月，经河海大学申请，水利部人事劳动教育司批复，同意“河海大学机械学院”更名为“河海大学常州分校”，河海大学机械学院电子工程系更名为河海大学计算机及信息工程学院。

1996年5月3日，河海大学机械学院举行更名仪式，正式起用为河海大学常州分校，并为机电工程学院、计算机信息工程学院（常州）、国际工商学院（常州）颁发铜牌。

2000年6月，河海大学常州分校更名为河海大学常州校区，下设机电工程学院。