主要承担以下职能：

（一）编制全省农业节水发展规划，参与有关政策规章及技术标准的制定；承担全省农业节水技术的示范推广和旱作农业基地建设工作。

（二）贯彻执行《基本农田保护条例》和《耕地保养办法》，承担全省耕地资源的调查与质量评价；开展中低产田改良和培肥地力技术的示范推广；开展土壤墒情与旱情及肥力的长期定位监测工作；承担基本农田的保护管理和执法检查工作。

（三）承担新型肥料的肥效试验和质量监控及市场的准入与监管工作；开展科学施肥技术的示范推广与肥料市场信息的预测预报；承担甘肃省肥料评审委员会的日常事务工作。

（四）承担土壤改良、新型肥料、节水设施产品和技术的研究与开发，为相关部门提供社会化的技术服务；按照相关产业投资政策，做好土、肥、节水科技成果的转化工作。

（五）提出全省土壤肥料测试体系、质量监测网络体系建设规划并组织实施；组织全省耕地土壤肥力监测；承担市县检测人员培训；市场化肥质量抽检、为肥料企业开展内部质量控制和农户测土配方施肥提供检测服务，为政府及时掌握肥料和耕地质量动态提供科学依据。