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电泳分离现已成为生物化学、分子生物学、免疫化学等学科中各种带电物质分离鉴定的重要方法和手段，是医药学研究及药品生产、质量检验的重要手段。
电泳技术可以分离各种有机物（氨基酸、多肽蛋白质、酶、脂类、核苷、核苷酸、核酸等）和无机盐，并可以用于分析某种物质的纯度及相对分子质量测定。电泳技术与层析法、指纹图谱结合起来，可用于蛋白质结构的分析。
