节茎石仙桃的假鳞茎近圆筒形，肉质，有时两端略收狭，长（2-）4-12厘米，宽5-10（-25）毫米，彼此以首尾相连接，貌似长茎状，有时有少数分枝，在连接处有一段很短的根状茎或根状茎不甚明显，有时发出少数根。叶2枚，生于新假鳞茎顶端，花期叶已长成，倒卵状椭圆形、长圆形或狭椭圆形，长7-17.5厘米，宽2.7-6.2厘米，先端近急尖或钝，具折扇状脉；叶柄长1-1.5厘米。

花葶从假鳞茎顶端两叶中央发出，通常略长或短于叶；总状花序具10余朵花；花序轴或多或少左右曲折；花苞片狭卵状长圆形，长1.5-2.5厘米，宽5-7毫米，在花期逐渐脱落；花梗和子房长6-7毫米；花通常淡绿白色或白色而略带淡红色，2列排列，略疏松，各花相距4-5毫米；中萼片长圆形或椭圆形，凹陷成舟状，长9-10毫米，宽4-5毫米，背面具龙骨状突起；侧萼片卵形，斜歪，略宽于中萼片。

花瓣长圆状披针形或近倒披针形，长约7毫米，宽2-2.5毫米，与萼片均具5脉；唇瓣轮廓为宽长圆形，约在上部1/3-1/4处缢缩而成前后唇；后唇凹陷成舟状，略宽于前唇，近基部处有5条纵褶片；前唇横椭圆形，宽3-4毫米，边缘皱波状，蕊柱粗壮，长2.5-3毫米，顶端在药床周围有宽约1毫米的翅；蕊喙甚大，宽卵形至圆形，长1.4-1.8毫米，先端有短尖头。

蒴果椭圆形至倒卵状椭圆形，长1.8-2厘米，略具3棱；果梗约2.5毫米。花期6-8月，果期10-12月。