1952年，东北人民政府林业部建设工程公司设计室建立。
1953年，东北人民政府林业部建设工程公司设计室更名为东北人民政府林业部设计公司。
1954年，东北人民政府林业部设计公司更名为中央人民政府林业部设计公司。
1965年，中央人民政府林业部设计公司更名为林业部基本建设总局东北设计院。
1981年，林业部基本建设总局东北设计院更名为黑龙江省林业设计研究院，行政级别定为副厅级，隶属于黑龙江省森林工业总局。
1994年，黑龙江省林业设计研究院建筑景观规划设计院成立。
2014年，黑龙江省林业设计研究院交通勘察设计二院成立。
