1、办公室

协助局领导组织机关日常工作。对各股室工作进行综合协调，负责综合性会议的组织工作，负责对外宣传、秘书、公文、政务信息、督查、档案、保卫、保密、信访、工会、青年、妇女、计划生育工作及机关后勤事务工作；负责机关及下属单位的人事管理、劳动工资、机构编制、职称评聘工作及离退休干部职工的管理服务工作，归口管理全县水务系统的教育、培训工作；负责水务行业的对外合作和交流工作；负责机关财务及全县水务行业的财务、审计、会计管理，对全县水务系统的国有固定资产进行监督管理；负责水务综合统计工作；对全县水务横向资金进行协调；负责协调全县水务企业的行业管理。

2、水政水资源股

主管全县水务行业政策法规、体制改革和水行政执法工作；负责水资源统一管理和保护工作，负责组织实施取水许可制度和水资源费、河道采砂费征收管理制度；执行水政监察和实施水行政处罚及水事违法案件的行政复议工作；归口协调跨乡镇和部门之间的水事纠纷；主管全县节约用水和城镇供水水资源规划工作；组织全县水资源调查评价；会同有关部门制订跨乡（镇）的水量分配方案并组织实施。

3、水利电力股

负责编制全县水利水电发展规划，主要河流的流域规划及中长期和年度综合计划以及水利、水电基建项目的建议书和可行性研究报告的立项审批；主管全县农田水利、灌区、机电排灌和乡（镇）供水、人畜饮水工作，组织指导全县农田水利基本建设和农村水利社会化服务体系建设；负责农村节水工作，组织协调全县水利工程建设和验收，对全县水工程建设进行行业管理，主管全县水利水电建设监理和质量监督工作；对《中华人民共和国河道管理条例》组织实施和监督检查；负责全县河道、水库等水域、岸线、河口滩涂以及水利工程的管理和保护，负责全县堤防工程建设和管理，负责全县水利水电综合经营，对江河和水利工程的防洪安全进行行业管理，对全县水库大坝安全实施监督管理，归口管理水库渔业和水利水电旅游事业；负责编制全县水利水电科学发展规划和计划，组织水利水电科学研究，引进推广水利水电新技术、新成果、搜集整理水利水电科学资料，主管水利行业技术标准、规程规范、技术监督等工作。

主管水务系统开发建设的小水电，对小水电站进行归口管理，组织协调全县小水电工程建设和验收，负责农村水电电气化县建设，归口管理乡（镇）水管站。

4、供排水管理股

主管全县城镇供、排水、污水处理工作；负责编制城镇供、排水发展规划及年度计划，经审定后组织实施。组织重点给排水工程设计审查，监督招标、投标，负责质量监督，组织工程验收；编制给水调度方案，制订自来水价格标准，制订自来水入网管理办法，审批自来水入网许可证；负责节水、用水工作。推广节水新技术、新产品，组织检查和处理重大违章用水和浪费用水事件；全面规划污水排放系统，确保城镇污水科学合理排放；负责对参与本县供、排水工程勘察、设计、施工的单位进行资格审查。

5、防汛抗旱指挥部办公室

主管全县防汛抗旱工作。负责全县小（一）型以上水库分蓄洪工程的指挥调度，组织编制小（一）型以上水库分蓄洪工程的分洪方案；组织编制城市防洪规划；检查督促险工险段的处理及水毁工程的修复；负责防汛抗旱经费、物资的计划、储备、调配与管理；及时掌握气象、水文、雨情、险情、灾情变化情况，发布洪水预报和警报；负责汛期值班，负责全县防汛抗旱服务队的建设和管理。

另设纪检组（监察室），为县纪委（监察局）的派驻机构。