丽江市政务服务管理局内设7个科室:办公室、政策法规科、政务服务管理科、行政审批管理科、电子政务和信息技术科、交易市场监督科、招标投标监督科。
丽江市政务服务管理局(市公共资源交易管理局)领导管理两个中心:市政务服务中心和市公共资源交易中心。市政务服务中心是提供政务服务的公共平台,由各相关单位进驻服务窗口组成;市公共资源交易中心为市政务服务管理局下设的独立公益性事业单位,机构规格为副处级法人组织,设5个内设科室,承担建设工程项目招投标、政府采购、国有产权转(出)让、国有土地和矿业权转(出)让交易服务工作。