根据上述职责，县交通运输局设3个内设机构：

（一）办公室

协助管理局机关日常工作，负责会务会议组织、文电、文件处理、信访、档案、机要、保密、保卫、办公自动化及机关日常人事、劳动工资等工作；承担综合性报告、文件起草和政务公开工作；承担局机关和直属单位机构编制、组织建设、人事管理、综合治理、精神文明建设、宣传和外事工作；负责交通运输系统劳动保护、卫生监督和从业人员教育培训；组织实施交通运输科技和信息化发展政策，负责交通运输行业信息化建设和管理；负责局机关和直属事业单位的离退休人员的服务管理工作等。

（二）综合运输和建设管理科

承担全县综合运输市场体系建设和监督管理工作，促进综合运输体系协调发展；组织客货运输市场调查，综合分析、预测交通运输宏观经济运行情况；牵头组织节假日客货运输工作；指导全县驾驶员培训和营业性客货运输站（场）等行业管理工作；负责公路、水路建设市场监管工作，组织协调公路、水路有关重点工程建设和工程质量、安全生产监督管理工作，负责权限内的建设项目及公路重点养护工程的设计审批、施工许可、实施监督和竣工验收工作；负责全县交通战备管理工作；规划县内国防交通路网布局，编制与指导实施国防交通建设计划；拟订全县国防交通保障计划，为辖区内的军事行动和其他紧急任务组织交通保障；负责全县国防运力动员和征用工作。组织指导交通运输科技项目的推广应用工作；监督实施公路、水路安全生产政策和应急预案；指导有关安全生产和应急处置体系建设；负责有关公路、水路运输企业安全生产监督管理工作；依法组织或参与有关事故调查处理工作；组织协调国家重点物资运输和紧急客货运输工作。组织实施交通运输地方性法规规章；承担相关行政执法、普法宣传、执法监督、行政诉讼、行政复议和综合治理工作；承担机关规范性文件的合法性审核工作；指导公路、水路行业体制改革有关工作。承担交通运输行政审批工作。

（三）财务科

负责交通运输系统贯彻执行国家和省、市财经法律法规，严格执行县财政各项规定；负责筹措、协调全县各项交通运输基本建设资金、核算各项交通工程项目；协调、核算局机关、所属事业单位人员经费和运转经费；指导、检查乡镇农村公路建设资金的管理和 使用；指导、检查交通系统企、事业单位财务管理和会计工作；参与编制交通行业发展规划和年度计划中的财务预算；负责局属单位的内部审计工作。