OMR软件是一种电脑软件，供电脑分析和处理有关数据。OMR软件的作用是把电脑扫描仪当作OMR专用的扫描器，利用电脑处理所输入的数据 并以使用者制定的方式（如：数据库）输出。有了OMR软件，我们可以利用电脑来处理问卷、多项选择题答题纸、出席纪录表等简单的数据。

在早期，处理OMR需要用特定的OMR扫描器，在OMR软件出现后，用家只需要电脑和扫描器就可以处理OMR数据。现代的OMR软件更可以自订数据标记位置，可让用家以激光打印机输出有关表格，不需像以往找印刷公司印刷表格，方便在仅需要小量表格的场合。

对于一些OMR准确度要求比较高的情况，用户会选择使用彩色卡纸作答，而扫描时扫描器则可以自动将卡纸的颜色抹除而留下答题者填下的标签颜色，准确度提高，相对印刷成本也相对提高。近年更有软件Smartshoot OMR 可以在原有OMR基础上，使用普通黑白油印纸，通过虚线过滤技术而达到同样抹除边框的效果，准确度提高的同时，成本也不变。