虽然土壤自身有一定的净化能力，但当进入土壤的农药量超过土壤的环境容量时就会形成土壤污染，对土壤生态系统产生严重的影响，同时还会通过食物链进入人体，对人体的健康造成危害。总之，土壤农药污染的危害可以概括为以下几个方面。

土壤农药污染对农作物的影晌

土壤中残留的农药会通过植物的根系活动逐渐转移至植物中．使得植物中的农药残留量增大，影响农产品的质量，造成农民的经济效益下降。

土壤农药污染对土壤生物的影响

很多农药都会毒杀土壤中的生物，如蚯蚓等。蚯蚓是一种重要的土壤有利生物。可以使土壤保持疏松状态并能使土壤中的肥力提高，但是部分高毒农药会杀死蚯蚓。

土壤农药污染对土壤微生物的影响

不同的农药对土壤中微生物的影响也不同。同一种农药对不同种微生物类群的影响也不同，但总的来讲农药可影响土壤微生物的种群和种群数量。杀菌剂对土壤微生物影响较大，不管是有益微生物还是有害微生物，均被其杀灭或者是抑制生长，如硝化细菌和氨化细菌。此外，土壤中残留的农药还对土壤中的微生物数量造成一定的影响，使得土壤生态系统的功能失调，营养成分不平衡、失调或缺乏，对土壤中生物的生长和代谢不利。

土壤农药污染对人畜健康的影响

土壤中残留农药可被粮食、蔬菜作物吸收，使之遭受污染，并通过食物链危害人畜健康。另外，还可随着土壤表层饮用水进入人或动物体内，对人体的健康造成直接或间接的危害，影响人们的正常生活。

土壤农药污染其他影响

土壤中残留的农药还会使土壤的物理性状发生改变。养分不均匀，最终导致农作物的产量和质量下降。土壤长期受农药影响，最终会使土壤明显酸化。此外，还会使土壤受重金属污染，造成不可挽回的损失。当土壤中的残留农药通过影响某种生物的数量从而影响了当地的生物链就会严重影响环境。比如农药通过稻穗使鸟类数量大减从而使田鼠数量剧增，并进一步影响当地植被物种，破坏环境。除此之物(污水)的任意丢弃排放造成农村生产生活环境的污染 。