指纹识别的应用仍存在一些问题，鉴于亲属之间指纹存在相似性， 算法的精度不高容易导致识别错误，而且在接触东西时遗留的指纹信息容易被他人引用，安全性不高，这就要求我们模式识别过程中提升算法的精度，并且综合除指纹外其它方面信息综合识别。
活体检测与指纹识别结合，避免遗留指纹被窃取而造成的不良后果，包括人脸识别、虹膜识别等多种识别技 术的综合性生物特征识别，提高识别结果的准确性；将指纹识别与信息登记一体化，建立庞大的数据库，经过指纹就可以查询登记信息， 包括学生信息、公民信息、获奖信息等，进行开锁操作，包括门锁、 车锁、手机锁等，这样的一体化信息会极大的方便人们的生产生活。
由于指纹容易伪造，其被盗用的概率不可忽视，指纹识别设备对于活体识别的需求将显著提升。并且指纹识别技术因其易获得性造成指纹被盗用，指纹识别技术在应用过程中的安全性和可靠性有待进一步提高，因此，结合其他生物特征（如虹膜、声纹、静脉等），克服单一生物是被技术的不足，将会是指纹识别技术发展的重要方向。此外，随着可穿戴式设备与互联网的迅猛发展，指纹识别技术在可穿戴设备的应用将更为广泛。
