（一）办公室。负责局机关日常运转工作，承担信息、安全、保密、信访、政务公开、政务信息化、新闻宣传、党风廉政建设、行政监察、文明创建、综治维稳、档案管理、后勤保障等工作。

（二）财务审计科。承担局机关财务日常工作。负责编制本级水利部门资金收支计划，组织指导局属单位预算编制工作；监督管理和指导水利专项资金的使用；监督水利行业国有资产的运行使用；负责局属单位财务管理；负责市承办的水利重点工程建设资金的管理和会计核算；负责内部审计、局属单位班子成员的任期经济责任审计以及国债资金的审计等。

（三）政策法规与水资源科（行政审批服务科）。落实水利工作的政策并监督实施；承办局行政应诉、行政复议和行政赔偿工作；组织指导水政监察和水行政执法；承担实施最严格水资源管理制度相关工作，组织实施水资源取水许可、水资源论证等制度，指导开展水资源有偿使用工作；指导水量分配工作并监督实施，指导河流、水库生态流量水量管理；组织编制水资源保护规划，参与饮用水水源保护有关工作；按规定组织开展水资源调查、评价和水资源承载能力监测预警有关工作，组织编制并发布市级水资源公报；组织编制并协调实施节约用水规划，组织指导计划用水、节约用水工作；组织实施用水总量控制、用水效率控制、计划用水和定额管理制度；指导和推动节水型社会建设工作；指导城市污水处理回用等非常规水源开发利用工作；负责行政许可、行政确认和与投资建设项目审批相关的其他职权的受理工作，并牵头组织开展论证、审核、上报等相关程序性工作；负责行政审批决定及行政许可证或审批文件的送达工作；负责制定行政审批和政务服务事项的工作制度、工作流程等工作；负责本部门行政审批事项的统计分析和案卷整理归档工作；负责落实行政审批制度改革的相关工作任务；承担水土流失综合防治工作，组织编制水土保持规划并监督实施，组织水土流失监测、预报并公告，审核权限内开发建设项目水土保持方案并监督实施；负责水土保持补偿费征收使用制度的实施；指导水域及其岸线的管理和保护，指导河流的开发、治理和保护，指导河库水生态保护与修复工作；监督管理河道采砂工作，指导河道采砂规划和计划的编制，组织实施河道管理范围内工程建设方案审查制度。

（四）规划建设与工程管理科（水库移民科）。拟订水利规划，组织编制重大水利综合规划、专业规划和专项规划；审核重点水利建设项目建议书、可行性研究报告和初步设计；组织指导有关防洪论证工作；指导水工程建设项目合规性审查工作；组织实施市级水利建设投资计划，统筹协调项目实施的监督管理；指导水利工程建设管理，拟订有关制度并组织实施；指导水库、水闸、堤防等水利基础设施建设，指导重要病险水库（水闸）、重要堤防的除险加固；组织指导水利工程蓄水安全鉴定和验收；组织实施水利工程质量监督；指导水利建设市场的监督管理和水利建设市场信用体系建设；指导水利设施的管理、保护和综合利用，组织编制水库运行调度规程，指导水库、水电站大坝、堤防、水闸等水利工程的运行管理与划界；督促检查水利重大政策、决策部署和重点工作的贯彻落实情况；组织实施水利工程安全监督；指导水利行业安全生产工作，指导水库、水电站大坝等水利工程的安全监管；承担水利统计工作；负责大中型水库移民管理工作，审核大中型水利工程移民安置规划和后期扶持规划并组织实施，承担大中型水库的移民搬迁安置和后期扶持工作；组织实施大中型水库移民安置验收和监测评估制度；负责管理大中型水库移民资金。

（五）村镇供水管理科。负责编制全市村镇供水规划与年度计划，负责指导全市农村饮水安全工程建设管理，指导村镇供水行业的安全生产工作，指导村镇供水工程的运营管理。

（六）水旱灾害防御科（农村水利水电科）。组织编制洪水干旱防治规划和防护标准、重要河流和重要水工程的防御洪水抗御旱灾调度以及应急水量调度方案并组织实施；承担水情旱情预警工作；承担台风防御期间重要水工程调度工作；承担防洪保护区的洪水影响评价工作；承担市域范围内水资源供需形势分析，指导水资源调度工作并监督实施；组织指导大型调水工程前期工作；指导监督市域范围内调水工程的调度管理等工作；组织开展大中型灌排工程建设与改造，指导节水灌溉有关工作；承担水能资源的监督管理工作；组织拟订农村水能资源开发规划，指导水电农村电气化、农村水电增效扩容改造以及小水电代燃料等农村水能资源开发工作；指导农村水利改革创新和社会化服务体系建设。

（七）政工人事科。负责局机关和所属单位机构编制、人事劳资、职称考评、考核、教育培训、老干、关协、统战、武装、计生等工作。

机关党委。负责局机关和所属单位的党群工作。