根据上述职能调整,玉溪市水利局内设5个职能处室(正科级):
(一)办公室
协助局领导组织、协调机关日常工作;承办文秘、档案、政务信息、保密、机要通信、重大会议组织、督查、办公自动化、宣传报道和信访工作;负责机关内部规章制度的建立健全和完善,负责局机关财务、国有资产、安全保卫等行政管理工作;负责内外联系、协调工作。
(二)人事教育处
承办局机关及直属单位的机构编制、人事、劳动工资和职称工作;承办直属单位局管干部的管理工作和职工的年度考核,指导水利行业劳动保护、安全生产和职工队伍建设;负责水利行业职业技能工作;拟定水利教育发展计划,组织局管干部、国家公务员和科技干部的教育培训,指导水利行业职工培训工作。
(三)计划财务处
负责全市水利、渔业年度建设计划的编制上报;拟定水利行业的经济调节措施,对水利资金和渔业资金的使用进行调节并实施监督;研究提出有关水利的价格,税收,信贷,财务等经济调节意见;负责水利行业财务,会计的管理工作;监督和管理水利行业国有资产;负责水利资金使用情况和水利工程项目建设管理情况的内部审计,监督;指导监督水利行业的内审工作;承办水利综合统计工作。
(四)水政水资源处(水政监察支队、全市节约用水办公室)
组织、协调水利(渔业)法规、政策的实施;指导水政(渔政)监察和水(渔业)行政执法工作;承办县(区)间和部门间的水事纠纷协调工作;承办水利(渔业)行政诉讼,行政复议和普法教育工作;承办水资源的统一规划,管理和保护工作;组织实施取水许可制度和水资源费征收;组织实施水土流失防治费和水土保持设施补偿费的征收。
(五)防汛抗旱处(挂玉溪市防汛抗旱指挥部办公室牌子)
组织全市防汛抗旱工作,承办市防汛抗旱指挥部的日常工作;按照市防汛抗旱指挥部的指示,对全市水利设施的水量实施统一监控和调度,对全市重要江河、湖泊实施统一监控和调度,组织对江、河、湖泊和水利工程的防洪安全管理;指导城市防洪工作;参与其它自然灾害的抗灾工作。