县交通局设5个职能科（室）。

（一）办公室

组织、协调局机关工作；起草重要报告、综合性文件；负责文秘、政务信息、机要、保密、信访、档案和局机关后勤行政管理工作；组织和指导交通行业政策研究工作，负责起草研究报告、行业政策文件；负责行业立法的规划、组织、协调；归口管理和指导交通执法监督检查；负责组织和指导全县交通行业的"普法"工作；按干部管理权限和范围负责局机关、直属单位干部、职工的人事管理、机构编制和党建群团工作；负责落实知识分子、专业技术职称、智力引进和对外劳务合作的工作；负责交通行业社会团体管理，配合从事全县交通行业工种人员职业技能培训、鉴定工作。

（二）计划建设科（交通战备办公室）

组织实施交通行业年度固定资产投资计划；负责交通行业外资引进和设备进口及合资项目工作；监督交通基础设施建设和维护、管理方面的规章制度、主要定额的实施情况；负责检查交通基本建设项目技术问题，协调交通建设工程中的有关事宜；负责公路、水路交通战备工程的组织实施；负责管理交通行业监理单位以及交通建设市场勘察设计、咨询监理、施工单位资信登记；管理设计、监理、施工的招投标工作；开展交通扶贫工作；负责公路及其设施的维护和管理；管理交通建设工程质量监督和施工监理及工程造价工作；组织实施公路、水运工程质量检验、评定、管理和监理办法；管理和指导交通行业科学技术工作。

（三）财务审计科（车辆购置附加费征收管理办公室）

负责交通行业财务会计管理；组织编制企业财务计划和事业预算，定期检查、分析各项财务指标；综合编审企业、事业会计决算；负责交通规费的收支管理；负责车辆购置附加费的征收；管理外汇、信贷、税收及利用外资有关的财务工作；负责交通基础设施专项建设基金的筹集；负责对局属单位的审计；负责对在公路上非法设卡收费行为的调查、报告和处理。

（四）运输管理安全监督科

行使交通运输行业管理职能；负责对全县公路、水路非法营运行政处罚，配合拟定运价政策；对国家重点物资运输和紧急运输进行调控；负责涉外运输管理；负责内河安全监督管理和局属企业安全生产管理；归口管理交通行业交通安全工作；组织指导行业环境保护工作；行使交通通信行业管理职能；指导运输管理所做好水上安全工作。

（五）公路路政管理科

行使公路路政的行政管理职能，主管全县公路路政管理工作；协调全县公路两侧建筑控制区、超过公路或公路桥梁限载标准的车辆行驶公路和公路路产管理工作；负责指导全县公路路政队伍建设；指导公路路政管理所工作；负责局机关安全保卫工作，管理、指导局属单位的安全保卫工作。