1、地下水资源与开采管理的职责分工

昆明市自然资源和规划局负责地下水（含地热水、矿泉水）的统一管理，昆明市水务局配合做好地下水的管理工作。昆明市自然资源和规划局负责监督管理因地下水过量开采引发的地面沉降等地质问题。

2、组织编制国土空间利用及领域专项规划的职责分工

市交通、能源、水利、农业、信息、市政等相关主管部门对编制公共服务设施、军事设施，以及生态环境保护、文物保护、林业草原等专项规划负责。昆明市自然资源和规划局对组织衔接各专项规划负责。

3、河道采砂管理的职责分工

昆明市交通运输局负责影响通航安全河道采砂的查处，参与编制通航河道采砂规划和计划、河道采砂的水上执法监管。昆明市水务局牵头监督管理河道采砂工作。昆明市自然资源和规划局负责保障河道内砂石资源合理开发利用。

4、历史文化名城保护的规划建设职责分工

昆明市自然资源和规划局负责历史文化名城保护的规划编制。

昆明市住房和城乡建设局负责历史文化名城保护的建设管理。

5、地质灾害应急与防治管理的职责分工

昆明市自然资源和规划局负责编制地质灾害防治规划和防护标准，组织指导、协调和监督地质灾害调查评价及隐患的普查、详查、排查；指导开展地质灾害群测群防、专业监测、预报预警和灾情报告等工作；指导开展地质灾害工程治理工作；承担地质灾害应急救援的技术支撑工作。昆明市应急管理局牵头会同相关部门建立统一应急管理信息平台和监测预警、灾情报告制度，健全自然灾害信息资源获取和共享机制，依法统一发布灾情。

6、主城区国土空间规划管理的职责划分

昆明市自然资源和规划局受市政府委托负责编制国土空间规划，负责组织编制控制性详细规划。

五华区、盘龙区、官渡区、西山区、呈贡区政府和高新区、经开区、滇池度假区管委会负责辖区规划行政许可及批后监管、规划核实。

7、自然资源管理行政审批事项的职责分工

昆明市自然资源和规划局统筹全市国土空间用途转用和建设项目行政审批事项工作，按照“放管服”要求指导和监督各县（市）区开展行政审批工作。各县（市）区负责辖区内自然资源开发利用预初审和报批，组织实施自然资源开发利用与管理，执行落实各项用途管制和技术规范标准。

8、昆明市自然资源和规划局联系并负责指导云南滇中新区自然资源管理业务。