晋中市水利局组织机构的设立最早是在1951年3月，汾阳专署撤销后与晋中行署合并为榆次专署，成立了榆次专署水利局。在此之前，晋中水利事业由晋中行署农业处承办。1954年11月到1971年10月，水利与农口各局多次分合，先后称专署农林水利局、晋中水利管理局、晋中地革委农林水利办公室等。1971年10月，撤销地革委农林水利办公室，成立晋中地区革命委员会水利局；1978年5月更名为晋中行署水利局，1983年10月改称晋中行署水利水保局。2000年12月晋中地改市后，撤销晋中行署水利水保局，成立晋中市水利水保局，2001年8月改称晋中市水利局。
