中心以“服务经济、方便群众、塑好形象”为宗旨，以“宁可自己麻烦百次，不让群众麻烦一次”为理念，以实现“一个窗口办理、一条龙服务、一站式办结、一次性收费”为运作模式。建立“六七八”工作机制，对办理项目实行“六公开”、“七制”管理和“八件”办理制度。坚持能进则进、一事一地、充分授权的原则，按照审批、监管、服务适度分离的思路，先后进行六轮审批流程改革，创建了用地预审联审及生产性工业项目准入审查平台，实行并联审批，选择工商局、经济发展局、商务局、规划建设与房产管理局、国土资源局、环保局、卫生局等11个主要部门专设审批科成建制进驻中心，建立分管领导进中心办公制度，每周进中心办公次数不少于两次。

中心建立协同办公平台与网上审批管理信息平台，分设外网网站和内网电子政务管理信息系统，集网上预申报、预审核、审批业务流转、绩效考核、政务公开、网上电子监督等重要功能于一体。07年1月6日网上审批系统正式开通，至今共有13个部门81个审批项目实现网上审批服务。实施市县联动，实现审批数据快速网上互动传输，提高县级报批件项目到泉州市级审批的效率，并成立市镇联动东石工作点暨网上审批东石代办点；实行非税收入“收支两条线”，把各窗口收费情况纳入中心监管；开发行政审批内部监察系统，实现实时监察、预警纠错、绩效评估、信息服务、决策辅助、数据介入六大功能，将进驻中心各部门的行政审批业务纳入电子监察范畴。中心实行朝九晚五作息工作制度，实行窗口服务量化绩效考核办法，建立“窗口围着群众转，部门围着窗口转”的运作机制，为市重点投资项目设立服务专窗，开辟特别通道，实行特事特办、跟踪督办、预约办理、协助代办、联合踏勘、联合会审等优质服务。