军事上的需要是推动毫米波系统发展的重要因素。毫米波在雷达、制导、战术和战略通信、电子对抗、遥感、辐射测量等方面得到了广泛应用。其中战略通信与电子对抗是非常重要的应用方向。电子对抗是指敌对双方均利用电子设备或器材所进行的电磁斗争，是现代化战争中的一种重要手段。

随着毫米波雷达和制导系统的发展，相应的电子对抗手段也发展起来。现代战争除去强火力和高密度外，一个重要的特点就是整个战斗是在激烈的电子对抗中进行的。因此，要求通信设备必须具有很强的抗干扰能力，而毫米波在这方面表现出明显的优势。例如，选择60GHz、120GHz、200GHz三个“衰减峰”频段上的舰对舰的毫米波通信，利用这些频段上信号严重衰减的特点，可极大提高舰对舰之间通信的抗干扰和抗截获能力。国外还大力开展了毫米波频段的测向机、干扰机和信号分析器等电子对抗设备的研制。

毫米波波束很窄，天线的旁瓣可以做得很低，使侦察和有源干扰都比较困难，因此，无源干扰在毫米波段有较大的发展。对35GHz以下的毫米波，最常用的干扰手段就是投放非谐振的毫米波箔条和气溶胶，对敌方毫米波雷达波束进行散射，它可以干扰较宽的频段而不必事先精确测定敌方雷达的频率。除此之外，也还可以利用爆炸、热电离或放射性元素产生等离子体，对毫米波进行吸收和散射，以干扰敌方雷达。

现役的多数雷达侦察、告警系统的频率覆盖范围均已扩展到0.5GHz～40GHz。据报道，美国的电子对抗设备中部分雷达侦察设备频率可达到110GHz，正在向300GHz发展。雷达告警设备频率已扩展到40GHz～60GHz，北约正研制一种车载毫米波告警设备，频段为40GHz～140GHz。此外，通信侦察频段覆盖10GHz毫米波段，通信干扰部分40GHz以下已实用化，正在向110GHz发展。在毫米波段还可以利用隐身技术。在对付有源毫米波雷达时，同在微波波段一样，可以采用减小雷达截面的外形设计，或者在表面涂敷铁氧体等毫米波吸收材料，以减小反射波的强度。对于通过检测金属目标的低毫米波辐射与背景辐射之间的反差来跟踪目标的无源雷达，则要在目标表面涂敷毫米波辐射较强的伪装物，使其辐射和背景辐射基本相等，从而使目标融合于背景中。

总之，毫米波通信应用于军事上是非常必要和有重大意义的，是很有发展前途的通信手段，具有波束窄、数据率高、电波隐蔽、保密和抗干扰性能好、开设迅速、使用方便灵活以及全天候工作的特点。除了应用于电子对抗领域外，军用毫米波通信的应用包括远（外空间）近（大气层）距保密通信、快速应急通信、对潜通信、卫星通信、星际通信、微波干线上下山的走线和电缆中断抢通设备等。