为确保水工建筑物的安全，在水库遭遇设计洪水时，库水位应不超过设计洪水位；遭遇校核洪水时，库水位应不超过校核洪水位。前者称水库正常运用，后者称水库非常运用。
可以采用库水位或者入库流量作为控制运用的判别指标。按照预先制定的运用方式蓄泄洪水（参见水库设计最大泄洪流量），控制库水位不高于设计洪水位。
当库水位己达到设计洪水位并将超过时，对有闸门控制的永久性泄洪设施（包括非常溢洪道等），可打开全部闸门或按规定的泄洪方式泄洪，以控制发生校核洪水时库水位不超过校核洪水位。如需启用临时性泄洪设施，而启用后会使下游产生严重的淹没损失，或可能冲毁部分水工建筑物，影响水库效益，造成严重后果时，则需要慎重拟定合理的启用条件（称启用判别指标）。通常以库水位略高于设计洪水位，或以入库流量略超过设计洪峰流量且有上涨的趋势作为临时性泄洪措施的启用条件。具有较大蓄洪能力的水库，以库水位作为启用条件比较可靠，而且易于掌握。库容较小，设计洪水位与校核洪水位相差不大的水库，以入库流量作为启用条件比较安全．水库非常运用时，宜严格控制泄量不超过入库最大流量，以免人为增加下游的洪灾损失。
多泥沙河流水库的防洪调度，还应专门研究采用可减少泥沙淤积数量和改善淤积部位的调度方式
