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水芫花具有独特的二型花柱繁殖体系，自交不亲和，因此必须同时具备二型花柱并具有有效授粉媒介才能正常结实，形成有繁殖力的后代。而中国海南省文昌市清澜港的水芜花种群植株数目太少，可能达不到适当的花型比例，或者缺乏适当的授粉媒介，这都可能是采收种子无法萌发的原因。然而，水芫花不易种子繁殖的详细机理及其相应的保育措施。
