有特色高水平大学和一流学科专业建设要紧密结合国家和江西经济社会发展需要,加强总体规划，科学合理布局，以学科专业为抓手，分层次、分阶段实施，通过重点建设若干所大学和一批学科及专业，推动一批有特色高水平大学强特色、上水平、增贡献。
有特色高水平大学和一流学科专业建设分为三个层次。
一是有特色高水平大学整体建设。有特色高水平大学整体建设依据目标定位不同分为高水平大学整体建设和有特色高水平大学整体建设。高水平大学整体建设面向综合实力较强，排名在国内比较靠前的大学，通过建设，近期目标是跻身国内一流大学行列，远期目标是冲击世界一流大学。有特色高水平大学整体建设面向行业特色鲜明，学科水平较高的大学，通过建设，近期目标是成为国内行业领先的有特色高水平大学，远期目标是冲击国际同类大学一流行列。
二是学科建设。一流学科建设依据目标定位不同分为优势学科、成长学科、培育学科三个层次。优势学科，面向学术，主要突出学科水平，目标是瞄准科学前沿、技术创新、弘扬优秀文化，跻身国内或世界一流。成长学科，面向学术，紧密对接国家和我省战略性新兴产业转型升级需求，发展势头良好的学科，目标是冲击国内一流，为区域经济社会发展起重要支撑作用。培育学科，主要面向我省产业和社会发展需要，有较大发展潜力的学科，目标是面对产业和社会发展需求，助其积蓄力量、尽快形成特色，服务产业和社会发展。三个层次的学科建设数量均为10个左右，共计30个左右。
三是本科专业建设。一流专业建设依据目标定位不同分为优势专业和特色专业两个层次。其中优势专业，主要面向师资力量强、办学条件优、教育质量高、社会声誉好、毕业生深受用人单位青睐的专业，目标是塑造江西高校品牌，跻身国内或世界一流。特色专业，主要面向专业特色鲜明、社会需求旺盛、在推动区域经济社会发展中能起重要作用的专业，目标是紧密对接社会需求，做强做特，在学校转型发展和人才培养中起引领示范作用。优势专业建设数量为20个左右，特色专业建设数量为30个左右，共计50个左右。
第一阶段（2016-2020年），重点是遴选建设一流学科、专业，同时，依据国家一流大学和一流学科遴选结果，启动有特色高水平大学整体建设。为策应国家中西部高校“一省一校”重点建设计划的实施，将南昌大学列为省高水平大学整体建设高校；其他高校如有入选国家“世界一流学科”建设对象，则该校列为省有特色高水平大学整体建设高校。
第二阶段（2021-2025年），继续以一流学科专业建设推进有特色高水平大学建设，巩固建设成效，释放建设经验，适当扩大建设规模。根据第一阶段建设成效，将建设成效显著的一流学科所在高校，列为省有特色高水平大学整体建设高校。
第三阶段（2026-2030年），进一步提升一流学科专业和有特色高水平大学建设水平，放大建设成效，在已形成的高等教育高地上，重点构建具有国际水平的学科高峰和国际名校，为江西高等教育长远发展奠定坚实基础。
列为省有特色高水平大学整体建设两个层次的高校，省财政不再另外安排一流学科专业建设经费。各阶段已列为一流学科建设对象的各层次学科，其建设经费要惠及相关学科群与专业群，其覆盖的所有专业，不再纳入一流专业建设范围。
