微污染水源水处理：本方向主要开展微污染水库水处理、河湖水体循环过滤技术、水环境生态修复技术、河流水体旁路强化净化技术、河流生物接触氧化技术、地下水除砷除氟技术等的研究开发及成果转化。
水及废水处理技术：本方向主要开展集中城镇饮用水源保护与修复技术、受污染水源水处理及安全评价、城镇污水厂工艺提标改造、污水厂尾水资源化、农村分散式饮用水安全保障及污水处理技术等的研究开发及成果转化。
工业废水处理及资源化：本方向主要开展焦化废水深度处理及回用技术、矿井废水处理及回用技术、电厂废水处理及回用技术、高浓度有机废水厌氧处理技术、工业废水深度处理技术研究等的研究开发及成果转化。
