保护土壤资源，提高土壤－植物系统的生产能力，充分利用土壤－植物系统对污染物的净化能力，是环境土壤学研究的基本目的。它的主要研究内容包括：

①　研究土壤背景值。其方法是，积累原始性和基础性资料，建立土壤环境背景资料数据库，以保证研究资料的准确性、可比性、系统性和完整性。

②　研究土壤环境污染现状，进行综合评价，并根据国民经济发展的需要以及可能采取的环境保护措施，对土壤环境质量作出科学的预测。

③　研究土壤及其边界环境中污染物特别是主要污染物的迁移、转化和分布规律，弄清它们的来源和归宿。

④　定量研究人为污染因素（物理的、化学的和生物学的）对土壤物理、化学、生物学特性的微观机理和宏观生态效应。

⑤　研究土壤－植物系统污染的生态效应和卫生学评价，进行流行病学的统计相关分析和因果关系定量分析。如土壤及其边界环境污染对资源利用、生物生产力和生态效应的影响评价。

⑥　研究土壤－植物系统对主要污染物的净化功能和作用机理、反应动力学及其环境条件，为发展城市污水的土地处理系统提供科学依据。

⑦　建立土壤及其边界环境中污染物迁移、转化规律的生物物理化学行为数学模式，并通过实践不断加以修改和完善。

⑧　在严格的环境土壤学实验基础上，参考各种环境质量基准值，研究土壤环境标准。

⑨　综合污染源、污染物类型、污染方式、污染途径、土壤类型及其分布的地貌条件、地球化学特征、气候和水文条件等因素，计算土壤的环境容量，确定表述土壤环境容量的数学模式，为实行土壤污染的总量控制提供科学依据。

⑩　在发展国民经济的过程中，研究厂矿、企业、城市和大工程对土壤环境质量的影响。 通过实地调查和实验，研究土壤－植物系统及其边界环境的污染防治途径和措施。 研究土壤环境质量基准，例如收集和制备各种标准土壤样品、生物样品、纯化学标准品，建立跨部门的技术协作网，实现土壤环境分析测试方法的标准化。