某些低水溶性的蛋白质，如球蛋白、膜缔合蛋白和其他一些在20%～40%硫酸铵饱和度时能沉淀的蛋白质，在低盐浓度时。能被疏水吸附剂强烈地吸附，但是可以通过降低温度、加入有机溶剂、加人多元醇(特别是1，2-乙二醇)、加入非离子洗涤剂、增加离液序列高的离子(例如硫氰酸盐)、改变pH值等方法来削弱疏水区的相互作用，使蛋白质从吸附剂上洗脱下来。
同样，C4、C8、C18(脂肪链)和苯基取代的高效液相色谱(HPLC)柱，用于纯化多肽和蛋白质，也是建立在疏水吸附理论基础上的。
这种技术已成功地用于多种酶的分离纯化上，例如，用癸基或辛基的琼脂糖柱吸附，然后用1，2-乙二醇梯度洗脱从人胎盘中分离纯化葡糖脑苷脂-伊葡糖苷酶；用苯基琼脂糖凝胶柱吸附和pH 7.6的Tris-HCI溶液递减梯度洗脱的办法分离纯化由荧光假单胞菌产生的芳香酰基酰胺酶。 2100433B
