由于煤矸石山占有大量土地,利用煤矸石充填复垦造田、煤矸石山复垦造林成为了煤矸石利用的重要任务。裴宗阳系统研究了煤矸石山生态恢复的背景理论以及煤矸石山立地条件,指出煤矸石山生态恢复需重点研究煤矸石山植被恢复体系构建、立地条件系统、煤矸石山植被恢复的演替规律以及生态治理的评价体系构建。煤矸石复垦技术可消耗大量煤矸石,减轻煤矸石露天堆放所造成的环境污染,改善矿区生态环境。
煤矸石在农业上资源化利用主要体现在生产农肥和改良土壤两方面。煤矸石特别是高硫煤矸石中的硫化铁在高温下经氧化生成二氧化硫,再与氨合成生成硫酸铵。早在1992年刘大锰就报道了煤矸石的这种应用,经过试验发现所生产的硫酸铵是一种很好的肥料。
一般来说,新产生的煤矸石偏碱,而陈化后的煤矸石的pH值一般较低,高国雄等研究了煤矸石沙障对沙地土壤的改良效用,发现煤矸石能使沙地土壤增加细粒物质,提高土壤水分含量,改善土壤结构,增加土壤中有机质、全N、速效P、速效K的含量,可作为沙地土壤的改良剂,但是煤矸石应用于农业生产需要特别注意污染扩散问题。