根据上述职责，市重点项目建设管理办公室（市金融工作办公室）设5个内设机构：

（一）综合处

综合协调办机关相关工作，督促重大事项的落实；组织拟订重点项目建设管理和金融工作的有关政策、法规、规章和办法；承担办机关文电、会务、机要、保密、档案、信息、信访、政务公开等工作；负责办机关财务、资产管理、后勤服务和安全保卫等工作；负责办机关及直属单位机构编制、人事管理和离退休干部等工作；负责机关效能、宣传教育和精神文明建设等工作；协助有关部门做好金融人才培养和引进工作。

（二）项目规划处

组织编制重点项目中长期规划和年度工作目标；做好省级重点项目的筛选、申报工作；牵头开展全市重点项目储备和筛选工作，建立重大储备项目滚动实施机制，适时组织专家论证；研究、分析重点项目运行态势，提出协调、推进意见；参与安排年度重点项目资金结构总盘子；编制、筛选和安排市级重点项目前期工作经费盘子，做好前期经费使用情况的跟踪、管理工作。

（三）协调推进处

负责全市重点项目的融资，推进我市项目融资模式创新；会同有关部门按照基本建设程序开展重点项目前期工作，指导项目业主单位或筹建单位加快项目前期报批工作；协调有关部门做好重点项目招投标工作；协调重点项目竣工验收，参与重点项目后评价管理工作；定期组织专家开展重点项目效益评估；负责重点项目建设用砂等管理、服务工作；协调重点项目建设工作中存在的有关问题。

（四）督查处

负责重点项目监督检查工作，提出督查意见，定期跟踪落实整改情况；牵头重点项目年度绩效考评工作，提出奖惩意见；组织开展重点项目建设的评先、宣传等活动，推广介绍重点项目建设成效；建立重点项目参建单位绩效档案；督促有关部门加强重点项目建设安全生产的监督检查，参与市重点项目建设质量、安全事故的调查处理；负责市省重点建设项目征地拆迁指挥部业务归口管理工作。

（五）金融处

联系人民银行福州中心支行、省银监局、省保监局和在榕的银行、保险、信托等金融机构以及相关金融业组织，做好协调、服务工作；协助做好全市银行、保险、信托等机构设立、发展工作；支持金融机构推进金融业务创新，促进金融行业健康发展；分析研究我市金融行业的运行态势，提出促进金融发展的政策建议；协助有关部门推进融资性担保机构、小额贷款公司等规范发展工作。负责牵头研究落实防范金融风险的工作制度和程序；健全我市金融风险预警和金融突发事件处置机制；组织有关部门查处和打击非法金融机构和非法集资、假币、洗黑钱、非法证券等非法金融活动,维护福州金融稳定；推动我市金融征信体系建设；承担市防范金融风险联席会议的日常工作。