办公室，地质资料室（省地质资料馆），土地档案室（省国土资源图书馆），省地质博物馆。

全馆总建筑面积约1500平方米，主要电脑设备有A0彩色、黑白扫描仪，A0彩色绘图仪，服务器，图形工作站及20多台微机。

馆藏全省地质资料10800余种，13万多件；土地档案9800余卷（已接收），约5万件；图书2万余册。

馆藏地质资料的形成时间跨度较长，最早是1914年；来源较广泛，本省境内形成的大部分地质资料及邻省一些相关地质资料均有收藏；种类较齐全，可分为区域调查类，海洋地质调查类，矿产勘查类，水工环勘查类，物化遥勘查类，地质科学研究类，技术方法研究类及其他类等。土地档案主要有地籍调查类、耕地保护类、建设用地审批类。

丰富的馆藏地质资料，为全省地质勘查，矿产开发，矿政管理，地质环境保护，交通、水利、电力、国防基础建设，防灾救灾及教学科研等方面，提供了大量翔实的资料依据和重要的信息资源。

当前，我馆正加快地质资料和土地档案的数字化与社会服务网络化进程，努力推进地质资料与土地档案全社会共享，进一步为我省经济社会发展做出新的贡献。福建省国土资源档案馆构建了以光盘为存储载体，全文数据库和目录数据库为管理基础的地质资料查阅服务系统，形成目录检索、借阅申请、图文浏览、打印输出等一体化的管理服务新模式；对馆藏1万多档地质资料，逐档、逐件、逐页进行涉密清理，并建立了相应的涉密地质资料管理数据库和涉密地质资料借阅证管理制度。