集团公司下设17个处室、9个直属子公司及各项目部。
经营部、矿山工程部、财务部、人力资源部、机械设备物油部、监察审计部、宣传教育部、安全环保部、质量认证办公室、竣工资料办公室、深化国企改革办公室、公司上市办公室、初中高级职称评委会、法律顾问部、房地产管理部、战略研究发展部、办公室。
集团公司直属公司共9个子公司及各项目部：分别为云南省铁路总公司、云南水利水电工程有限公司、云南中航建设有限公司、云南环亚经济贸易开发有限公司、云南腾瑞房地产开发有限公司、云南华锐建材工贸有限公司、云南奥博建材机械设备销售有限公司、云南五华投融资有限公司、云南博昕工程建设中心试验有限公司及各项目部。
