(一)综合科。负责市政府党组会议、全体会议、常务会议、市长工作例会等的筹备、组织、服务、文字材料起草工作;统筹协调市政府领导同志公务活动;承担市长工作有关文稿、新闻稿件、简报信息的起草、整理和审核;承办市长签发文电及批示、工作要求的督办落实。
(二)综合研究室。负责市政府主要领导文稿等起草工作;负责起草《政府工作报告》;牵头组织完成全市重点调研课题,提出政策性建议;负责陇海兰新经济促进会、中国市长协会等组织有关西宁方面的协调、交流、联络工作;负责市政府经济发展研究等方面的工作。
(三)机要文电科。承担市政府和市政府办公室各类公文的收发运转和印鉴、档案、电子公文的管理职责;承办机要、文印、保密、文件交换、报刊订阅等工作;承担行政规范性文件的报备清理工作;承办机要、保密、档案等方面安排的相关工作任务。
(四)党政办公室〔机关党委(机关纪委)〕。负责市政府办公室机关及所属单位人事管理、机构编制、教育培训、工资调整和人事档案管理工作;承办挂职干部、公务出国(境)人员政审、管理等方面的工作;承担市政府办公室目标考核、绩效考核;负责市政府办公室党组会议、室务会议的组织安排、会务和有关决定事项的督办落实工作;负责市政府领导同志的服务事项和办公室财务、车辆等行政事务的管理工作;负责离退休干部的日常管理及服务工作;负责市直机关事务管理工作;承担市政府办公室党群工作、党风廉政建设、意识形态、精神文明建设、民族团结进步创建、机关效能建设和依法行政工作;承办市政府办公室纪律检查和组织协调反腐败工作;协助市纪委监委派驻机构做好监督执纪问责工作;承办市政府办公室纪检、宣传、统战、党建等方面安排的相关工作任务。
(五)秘书一科。负责办理发展改革、自然资源和规划、住房保障和房产管理、城乡建设、海湖新区、南川综合开发、多巴新城建设管理、湟水流域(西宁段)综合治理、重大项目建设等方面的文电、会务、调研和督办工作。联系人大、政协、编制、铁路、机场、油气等方面的工作。
(六)秘书二科(挂行政审批制度改革协调科牌子)。负责办理交通运输、外事及港澳台事务、行政审批服务、营商环境、政务公开、邮政管理、轨道交通等方面的文电、会务、调研和督办工作;承担市政府行政审批制度改革办公室的日常工作;组织开展政府职能转变和“放管服”改革的调查研究,提出工作建议;指导和推动各县区、各部门“放管服”改革工作。联系邮政等方面的工作。
(七)秘书三科。负责办理科学技术、卫生健康、医疗保障、市场监督管理、体育、市地方志编纂等方面的文电、会务、调研和督办工作。联系科协、妇联、红十字会、烟草等方面的工作。
(八)秘书四科。负责办理经济运行、工业、信息化、国资监管、经济协作与招商、大数据管理、商务流通、应急管理、统计调查、园区经济、保供稳价等方面的文电、会务、调研和督办工作。联系西宁市经济技术开发区、海关、统计调查、工会、工商联、贸促会、通讯、供电等方面的工作。
(九)秘书五科。负责办理水务、农业农村、林草、扶贫、供销、东西部扶贫协作、园博园和西堡森林公园建设等方面的文电、会务、调研和督办工作。联系气象、残联等方面的工作。
(十)秘书六科。负责办理教育、民族宗教事务、生态环境、城市管理、文化旅游、广播电视等方面的文电、会务、调研和督办工作。联系各民主党派、共青团、文联等方面的工作。
(十一)秘书七科。负责办理公安、司法、人民防空、信访、国防动员等方面的文电、会务、调研和督办工作。联系西宁警备区、武警部队、驻宁部队、法检、国安等方面的工作。
(十二)秘书八科。负责办理审计、民政、财政税收、人力资源和社会保障、退役军人事务、金融、公积金管理、公共资源交易、城市投资管理等方面的文电、会务、调研和督办工作。联系税务、金融等方面的工作。
(十三)信息督查科。负责督办省委、省政府决策部署的贯彻落实情况及上级领导批办事项;负责市委全体会议、常委会议、各领导机构协调小组会议、专题会议和市政府全体会议、常务会议、专题会议决定事项及市委、市政府确定的其他重点工作贯彻落实情况的督办工作;负责督促办理全国、省、市人大代表和政协委员的议案、建议、批评、意见和提案工作;负责“710”政务督办工作;负责全市政务信息的收集整理、调研分析和综合反馈工作,采编报送政务信息;负责市政府办公室信息公开工作。