（一）办公室。负责机关日常运转工作，承担信息、安全、保密、综治、信访、政务公开、新闻宣传等工作。

编制部门预算并组织实施，承担财务管理、资产管理和内部审计工作。组织提出中央及省、市、区水利财政资金安排建议，并统筹协调项目实施的监督管理和绩效评价。提出有关水利价格、税费、基金、信贷的建议。

负责机关和所属单位的干部人事、机构编制、劳动工资工作，负责水利行业人才队伍建设。承担水利体制改革的有关工作。负责机关和所属单位离退休人员的服务管理工作。

（二）工程建设股（水旱灾害防御股）。指导拟订全区水利发展战略、中长期发展规划和年度计划，指导编制全区重大水利综合规划、专业规划和专项规划，承办水利基建项目建议书、可行性研究报告和初步设计的审核及上报工作。指导水工程建设项目合规性审查工作。组织实施中央及省、市、区水利建设投资计划，承担水利统计工作。

指导水利工程建设，制定有关制度并组织实施。组织指导水利工程验收，指导重要河流干堤、重要水闸的除险加固。指导河道、河口的开发和治理。督促检查水利重大政策、决策部署和重点工作贯彻落实情况。

组织开展中小型灌排工程建设与改造。指导农村饮水安全工程建设管理工作，指导节水灌溉有关工作。指导农村水利社会化服务体系建设。

负责落实综合防灾减灾规划相关要求，组织编制洪水干旱灾害防治规划，落实洪水干旱灾害防护标准并组织实施。承担水情旱情监测预警工作。组织编制重要河道和重要水工程的防御洪水抗御旱灾调度及应急水量调度方案，按程序报批并组织实施。承担防御洪水应急抢险的技术支撑工作。承担台风防御期间重要水工程调度工作。

（三）水政水资源管理股（行政审批股）。指导起草、拟订水利工作的政策并监督实施。指导水行政许可工作并监督检查。承担局行政应诉、行政复议和行政赔偿工作。承担有关行政审批事项的办理与组织协调工作。组织指导水政监察和水行政执法，协调处理水事纠纷。组织查处涉水违法事件。

指导水量分配工作并监督实施，指导河道生态流量水量管理以及河道水系连通工作。组织编制水资源保护规划，指导饮用水水源保护有关工作。组织拟订节约用水制度，组织编制并协调实施节约用水规划，指导全区计划用水、节约用水工作。组织实施用水总量控制、用水效率控制、计划用水和定额管理制度。指导和推动节水型社会建设工作。指导非常规水源开发利用工作。组织指导中小型调水工程前期工作，指导监督调水工程的调度管理等工作。

指导全区水利设施的管理、保护和综合利用，组织实施水利设施运行调度，指导堤防、水闸等水利工程的运行管理与划界。指导水域及其岸线的管理和保护，指导河道、河口的保护，指导河道水生态保护与修复工作。指导监督管理河道采砂工作。指导实施河道管理范围内工程建设方案审查制度。

监督项目建设水土保持方案的实施。

（四）质量安全监督股。组织水利科学研究、技术引进、技术推广和科技交流工作。指导全区水利信息化规划、建设、管理工作，承担水利信息化建设相关工作。

组织实施水利工程安全鉴定，水利工程质量和安全监督。指导全区水利行业安全生产工作。

负责水利建设市场的监督管理和水利建设市场信用体系建设。