市代办中心负责直接在市本级审批项目的代办；负责为各区、县（市）涉及市本级权限内审批事项提供协办；负责对代办员队伍进行业务培训，对各区、县（市）代办机构提供业务指导。其中各科室具体负责以下工作：

项目审批代办制受理协调科：

负责服务窗口的日常管理；接受代办业务的咨询；受理、审核代办项目的委托申请；签订代办委托协议，交办已接受委托的代办项目；接受代办员的协调申请，及时了解、认真分析需协调事项的基本情况和主要矛盾，与相关部门进行沟通协调，对于难以自行解决的问题及时提交市行政服务中心；对协调完毕的事项做好跟踪服务，保证代办工作继续进行；向各区、县（市）代办机构提供业务指导和协办服务。负责代办中心的档案管理。

项目审批代办制项目代办科：

负责做好代办员的日常管理和服务；负责代办项目的任务分配；做好代办项目登记和初期的衔接，并对代办工作进展情况进行跟踪记录；具体开展项目代办工作；做好代办工作相关报表的编制工作。

项目审批代办制督导管理科：

督促代办工作的具体开展；做好代办员的业务培训和指导工作；制定完善代办中心内部各项管理制度；受理项目代办过程中的有关投诉，配合市行政服务中心监察室做好投诉的调查工作；配合有关部门对代办中心开展行风监督和社会评议工作。