路桥工程系

路桥工程系的前身是原黑龙江交通学校1958年组建的路桥专业教研室，同年开始招收路桥专业中专生，每年招生80人左右。

1987年黑龙江交通学校晋升为黑龙江交通专科学校，成立了路桥工程系。于1985年开始招收首届路桥专业专科生（路桥85-1，2班，共80人）。

1994年学校更名为黑龙江交通高等专科学校，开设有公路与城市道路、公路工程管理、工程测量、公路工程监理、高等级公路管理、工程造价等六个专科专业。

1997年黑龙江交通高等专科学校被原国家教委确定为27所全国示范性普通高等工程专科学校之一，路桥系的公路与城市道路专业被确定为全国高等工程专科示范专业。

建筑工程系

建筑系的前身是原哈尔滨工程高等专科学校1985年设立的建筑工程系。

哈尔滨工程高等专科学校始建于1953年（中专）。

1985年晋升为哈尔滨冶金测量专科学校。

1994年更名为哈尔滨工程高等专科学校。

黑龙江工程学院成立

2000年经教育部批准黑龙江交通高等专科学校与哈尔滨工程高等专科学校合并成立了黑龙江工程学院。全院包括路桥工程系、建筑工程系共设八个系部。

2003年学院进行了全院范围的学科专业整合，原建筑工程系的工程管理及房建工程专业与原路桥工程系合并成立了土木工程系，同时原建筑工程系改名为建筑系。

2005年土木工程系与建筑系合并，成立了土木工程系。

土木与建筑工程学院

2009年土木工程系升格为土木与建筑工程学院。