应急指挥中心设指挥长、常务副指挥长，下设现场监测组、现场救援组、现场保卫组、现场事故调查组、现场保障组。指挥长、常务副指挥长和各组长分别由消防支队长、市环保局分管副局长和市环保局、消防支队相关职能科室负责人担任。指挥中心设在市消防支队，对外公开挂牌。同时在整合环保、消防两单位原有救援设备的基础上，购置了环境应急监测专用车、细水雾防化洗消车、各种防化服以及生化洗消装置、液体吸收棉、水驱动排烟机、有毒物质密封桶、快速堵漏胶等设备，从物质上为有效应对突发环境污染事故奠定了基础。应急指挥中心为使工作更加切合实际，在基层和企业召开联席会议，根据不同情况制定相应的工作计划，使联席会议紧密联系实际。同时，为扩展应急队员的视野，指挥中心还组织相关领导外出学习考察，开拓思路，研究探索更有效的应急办法。

消防联动指挥中心为从实战着眼，在抓好日常预防工作的同时，还对全市重点企业、容易突发环境事件的区域和企业进行重点监管。要求这些企业必须建立可操作性的应急预案，避免突发环境污染事件发生。