1954年，《煤矿设计》创办，主管单位是中华人民共和国燃料工业部，主办单位是煤矿管理总局设计管理局。

1955年，该刊主管单位变更为中华人民共和国煤炭工业部，主办单位变更为中华人民共和国煤炭工业部设计管理局设计管理局。

1958年，《煤矿设计》杂志并入中华人民共和国煤炭工业部基建司管理。

1960年，该刊由于自然灾害原因而停刊。

1965年，中华人民共和国煤炭工业部设计管理总局筹备复刊《煤矿设计》杂志。

1966年，《煤矿设计》复刊，刊名更改为《煤矿设计通讯》。

1967年，由于“文革”原因该刊再次停刊。

1977年，《煤矿设计通讯》复刊。

1978年，主管单位变更为中华人民共和国煤炭工业部，主办单位变更为中华人民共和国煤炭工业部设计管理局。

1981年，该刊刊期由双月刊改为月刊。

1983年，主管单位变更为中华人民共和国煤炭工业部，主办单位变更为中华人民共和国煤炭工业部规划设计总院。

1989年，主办单位变更为北京煤炭设计研究院。

1991年，主管单位变更为中国统配煤矿总公司基建局。

1993年，主管单位变更为中华人民共和国煤炭工业部。

1998年，主管单位变更为中华人民共和国国家煤炭工业局。

2001年，主管单位变更为中华人民共和国国家煤矿安全监察局。

2002年，主办单位变更为中煤国际工程设计研究总院，为适应新形势发展的需要，经中华人民共和国科学技术部批准，《煤矿设计》杂志正式更名为《煤炭工程》。

2004年，召开创刊50周年座谈会暨第一届理事和专家委员会会议，并开通官网。

2006年，召开第二次理事会暨首届“《煤炭工程》杯”煤矿安全科技论文大赛颁奖会议。

2009年，该刊在线投稿系统上线运行。

2010年，《煤炭工程》主办单位变更为煤炭工业规划设计研究院。

2012年，召开“煤矿瓦斯综合治理与开发利用”研讨会暨《煤炭工程》杂志2012年年会；同年，召开2011年矿山绿色开采及可持续发展论坛”暨《煤炭工程》杂志2011年年会、第三届理事会。

2014年，主管单位变更为中国煤炭科工集团有限公司，主办单位变更为煤炭工业规划设计研究院有限公司。

2015年，召开创刊60周年座谈会暨《煤炭工程》杂志第四届理事会；同年，该刊微信平台上线运行。

2019年，该刊组建编委会，召开第五届理事会暨首届编委会会议。

2020年，主办单位变更为中煤国际工程设计研究总院有限公司 。